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三代试管过筛后还是有可能会出现空囊的情况。而导致移植后怀孕出现空囊的原因有很多，比如患者体内的雌孕激素分泌不全，无法提供胚胎发育所需要的元素，从而引起空囊出现。因此，建议女性三代试管移植后出现空囊的情况时要及时到医院明确病因，对症治疗，避免再次出现。
做三代试管移植囊胚怀孕后有出现空囊的可能，但一般都不是因为染色体的问题，因为三代试管在胚胎移植前会对胚胎进行染色体筛查，而导致移植后怀孕出现空囊的原因有很多，比如胚胎因素，如果移植的胚胎质量差，胚胎在子宫的发育缓慢，就有可能会出现空囊的情况。
三代试管移植囊胚怀孕后也会出现空囊的情况，而空孕囊的形成，有可能是男性精子问题引起的，比如环境污染以及食品因素，还有辐射影响等等因素，都有可能导致男性的精子受到伤害，继而引起空孕囊；其次有可能是孕妇内分泌失调引起的；再者染色体因素也是一个重要的因素，但三代试管的患者可以排出这一个因素；还有女性在怀孕期间如果生殖道受到感染，也会引起空孕囊；以及环境因素也会导致空孕囊的发生。